دانشگاه رازی
درخواست شاپا
پایگاه استنادی علوم جهان اسلام
بانک اطلاعات نشریات کشور
پژوهشگاه علوم وفناوری اطلاعات ایران
دبیرخانه کمیسیون بررسی نشریات علمی
سامانه رتبه بندی نشریات علمی کشور
سامانه جامع رسانه های کشور
کمیته بین المللی اخلاق در نشر

 آمار

تعداد نشریات23
تعداد شماره‌ها368
تعداد مقالات2,890
تعداد مشاهده مقاله2,566,166
تعداد دریافت فایل اصل مقاله1,821,828
صفری, هوشمند, افضلی, پریا, اطمینان, علیرضا, شیروانی, هومن, فریدونی, لیدا. (1401). بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های گونه Agropyron intermedium با استفاده از نشانگرهای ISSR و پروتئین‌های محلول برگ. , 1(3), 358-374. doi: 10.22126/cbb.2022.8391.1022
هوشمند صفری; پریا افضلی; علیرضا اطمینان; هومن شیروانی; لیدا فریدونی. "بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های گونه Agropyron intermedium با استفاده از نشانگرهای ISSR و پروتئین‌های محلول برگ". , 1, 3, 1401, 358-374. doi: 10.22126/cbb.2022.8391.1022
صفری, هوشمند, افضلی, پریا, اطمینان, علیرضا, شیروانی, هومن, فریدونی, لیدا. (1401). 'بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های گونه Agropyron intermedium با استفاده از نشانگرهای ISSR و پروتئین‌های محلول برگ', , 1(3), pp. 358-374. doi: 10.22126/cbb.2022.8391.1022
صفری, هوشمند, افضلی, پریا, اطمینان, علیرضا, شیروانی, هومن, فریدونی, لیدا. بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های گونه Agropyron intermedium با استفاده از نشانگرهای ISSR و پروتئین‌های محلول برگ. , 1401; 1(3): 358-374. doi: 10.22126/cbb.2022.8391.1022

بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های گونه Agropyron intermedium با استفاده از نشانگرهای ISSR و پروتئین‌های محلول برگ

بیوتکنولوژی و بیوشیمی غلات
مقاله 4، دوره 1، شماره 3، مهر 1401، صفحه 358-374    اصل مقاله (518.99 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22126/cbb.2022.8391.1022
نویسندگان
هوشمند صفری* 1؛ پریا افضلی2؛ علیرضا اطمینان3؛ هومن شیروانی4؛ لیدا فریدونی5
1بخش تحقیقات جنگل‌ها و مراتع، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمانشاه، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی،
2کارشناس سازمان جهاد کشاورزی استان کرمانشاه،
3گروه ژنتیک و بهنژادی گیاهی، واحد کرمانشاه، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمانشاه، ایران
4مدرس گروه کشاورزی دانشگاه پیام نور
5دانشجوی دکترای ژنتیک و به نژادی گیاهی دانشگاه ایلام
چکیده
مقدمه: تنوع ژنتیکی در جوامع گیاهی، پایه و اساس برنامه‌های اصلاحی می‌باشد؛ به‎طوری‏که در روش‌های متداول اصلاحی، جمعیت‌های مطلوب از داخل یک توده دارای تنوع ژنتیکی، انتخاب می‌گردد.
مواد و روش‌ها: تنوع ژنتیکی 13 ژنوتیپ از گونه‌ Agropyron intermedium با استفاده از نشانگر ISSR و پروتئین‌های محلول برگ در آزمایشگاه زیست فناوری مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمانشاه در سال 1399 مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: بر اساس نتایج تجزیه مولکولی داده‌های پروتئین، تعداد 15 باند مشاهده شد که فقط در چهار باند از آن‎ها، چند شکلی مشاهده شد. بیشترین تعداد باند، مربوط به ژنوتیپ 12G با 15 باند و کمترین آن، مربوط به ژنوتیپ‌های 4G و 5G با 11 باند بود. در مجموع، پروتئین‌های برگ توانایی تفکیک درون گونه‌ای مناسبی نداشتند. با این حال، با توجه به ماتریس تشابه و تجزیه‌ خوشه‌ای برای پروتئین‌های محلول برگ، ژنوتیپ‌ها در سه گروه قرار گرفتند. گروه اول شامل ژنوتیپ‌های 4G، 5G، 9G و 11G بود. گروه دوم را ژنوتیپ‌های 1G، 2G، 3G، 6G، 10G و 12G تشکیل دادند و در نهایت گروه سوم شامل ژنوتیپ‌های 7G، 8G و 13G بود. ژنوتیپ‌های گروه اول بیشترین فاصله ژنتیکی را با ژنوتیپ‌های گروه دوم داشتند. آغازگرهای ISSR در مجموع توانستند 86 باند تولید کنند که از این تعداد، 10 باند یک شکل مشاهده شد و سایر باندها چندشکل بودند. میانگین تعداد باند تولید شده توسط هر آغازگر برای 13 ژنوتیپ برابر 17/7 بود. آغازگرهای IS11، IS12 و IS14 بیشترین تعداد باند (10 باند) و آغازگرهای IS3، IS9 و IS15 کمترین تعداد باند (5 باند) را نشان دادند. بر اساس مارکر ISSR، چندشکلی مطلوبی در بین ژنوتیپ‌ها مشاهده شد و آغازگرهای IS3، IS5، IS9، IS10، IS11 و IS14 به عنوان آغازگرهای مناسب جهت بررسی‌های تنوع درون گونه‌ای در Ag. intermedium، تعیین شدند. با توجه به تجزیه خوشه‌ای بر اساس داده‌های حاصل از آغازگرهای ISSR، ژنوتیپ‌ها در سه گروه قرار گرفتند. گروه اول شامل ژنوتیپ‌های 1G، 2G، 3G و 5G بود. متوسط ضریب تشابه برای ژنوتیپ‌های این گروه برابر 667/0 بود. ژنوتیپ‌های 9G، 11G، 12G و 13G در گروه دوم قرار گرفتند که متوسط ضریب تشابه برای این سه ژنوتیپ برابر 656/0 بود. گروه سوم شامل ژنوتیپ‌های 4G، 6G، 7G، 8G و 10G با متوسط ضریب تشابه 660/0 بود. در مجموع، بر اساس نشانگر ISSR، ژنوتیپ‌های 2G و 5G دارای بیشترین فاصله ژنتیکی با ژنوتیپ‌های 6G، 7G، 8G و 10G بودند.
نتیجه‎گیری: ژنوتیپ‌های 7G و 8G دارای بیشترین فاصله با ژنوتیپ 5G بودند. از این‎رو، این دو ژنوتیپ به دلیل دارا بودن فاصله ژنتیکی، مواد ژنتیکی مناسبی برای برنامه‌های اصلاحی و استفاده از هتروزیس به منظور دست‌یابی به ارقام با ویژگی‌های برتر بوده و پیشنهاد می‌گردد از آن‎ها در مطالعات بعدی استفاده گردد.
کلیدواژه‌ها
علف گندمی کرکدار؛ تنوع ژنتیکی؛ پروتئین‌های محلول؛ نشانگر ISSR
مراجع
  1. Abbaszade, S., Jafari, A. A., Safari, H., & Shirvani, H. 2016. The study of genetic variation in Lolium multiflorum using ISSR molecular marker and karyotype traits. Modern Genetics, 11 (4), 579-590. [In Persian].
  2. Afkar, S., Karimzadeh, G., & Jafari, A. A. 2010. Genetic variation in tall Fescue (Festuca arundinacea Schreb) populations based on seed storage protein polymorphism. Journal of New Seeds, 11, 390-398. http://dx.doi.org/10.1080/1522886X.2010.525733.
  3. Arsalan, E., & Ertugrul, K. 2010. Genetic relationships of the genera Onobrychis, Hedysarum, and Sartoria using seed storage proteins. Turkish Journal of Biology, 34, 67-73. http://dx.doi.org/10.3906/biy-0812-24.
  4. Bhandari, H. R., Nishant Bhanu, A., Srivastava, K., Singh, M. N., Shreya, & Hemantaranjan, A. 2017. Assessment of genetic diversity in crop plants - an overview. Advances in Plants & Agriculture Research, 7 (3), 279-286. DOI: 10.15406/apar.2017.07.00255.
  5. Dickeduisberg, M., Laser, H., Tonn, B., & Isselstein, J. 2017. Tall wheatgrass (Agropyron elongatum) for biogas production: Crop management more important for biomass and methane yield than grass provenance. Industrial Crops and Products, 97, 563-663. https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2016.12.055.
  6. Dinelli, G., & Lucchese, C. 1999. Comparison between capillary and polyacrylamide gel electrophoresis for identification of Lolium species and cultivars. Electrophoresis, 20 (12), 2524-32.
  7. Doyle, J. J., & Doyle, J. L. 1987. A rapd DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, 19, 11-15.
  8. Farshadfar, M. 2012. Genetic variability and Karyotype analysis of some Agropyron species. Annals of Biological Research, 3 (3), 1515-1523.
  9. Farshadfar, M., Nowrozi, R., Safari, H., Shirvani, H., & Amjadian, M. 2018. Assessment of genetic diversity in Agropyron desertorum accessions using ISSR molecular marker. Future of Food: Journal on Food, Agriculture and Society, 6 (1), 20-29.
  10. Fasih, Z., Farshadfar, M., & Safari, H. 2013. Genetic diversity evaluation of within and between populations for Festuca arundinacea by ISSR markers. International Journal of Agriculture and Crop Sciences, 5 (10), 1468- 1472.
  11. Habibi, B., Farshadfar, M., & Safari, H. 2012. Evaluation of genetic diversity among 18 Lucerne genotypes (Medicago Sativa) Using SDS-PAGE Markers. International Journal of Agriculture and Crop Sciences, 4 (21), 1623-1626.
  12. Jafari, A. A., Salehi Shanjani, P., Kouhi, L., & Bakhshi Khaneki, GH. R. Genetic diversity and geographic relationship among 11 dactyis glomerata populations using total protein electrophoresis. Cellular and Molecular Research (Iranian Journal of Biology), 26 (3), 278-288. [In Persian].
  13. Kumar, M., Chaudhary, V., Sirohi, U., Kumar Singh M., Malik, S., & Naresh, R. K. 2018. Biochemical and molecular markers for characterization of chrysanthemum germplasm: A review. Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry, 7 (5), 2641-2652.
  14. Laemmli, U. K. 1970. Cleavage of structure proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature, 227, 680-685.
  15. Moradi, M., Farshadfar, E., & Safari, H. 2015. Evaluation of genetic diversity in Agropyron cristatum using ISSR molecular marker. Journal of Biodiversity and Environmental Sciences, 6 (5), 425-432.
  16. Moradi, P., & Jafari, A. A. 2006. Comparative study of forage quality in 26 Dactylis glomerata genotypes in order to produce synthetic varieties in Zanjan provienc. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research, 14, 175-180. [In Persian].
  17. Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingey, S., & Rafalski, A. 1996. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Molecular Breeding, 2, 225-238.
  18. Rajaram, S. 2010. International Wheat Breeding. The Proceeding of 11th Iranian Crop Science Congress: Crop Production. Tehran, Shahid Beheshti University, Pp 225-238.
  19. Safari, H., & Jafari, A. A. 2013. Drought resistance evaluation of forage yield in Elymus hispidus ‎genotypes. Watershed Engineering and Management, 4 (2), 73-83. [In Persian].
  20. Safari, H., Shirvani, H., & Etminan, A. R. 2016. Assessment of genetic variation in Agropyron intermedium accessions using cytogenetical and morphological traits. Modern Genetics, 11 (4), 623-627. [In Persian].
  21. Safari, H., Shirvani, H., & Fereidoni, L. 2017. The study of genetic variation for Lolium perenne using molecular and biochemical markers. Cellular and Molecular Research (Iranian Journal of Biology), 30 (4), 361-374. [In Persian].
  22. Sanghani, J. M., Sanghani, A. O., & Vadher, K. J. 2016. Molecular and Biochemical Assessment of Genetic diversity in Mungbean. LAP LAMBERT Academic Publishing, 124 p.
  23. Shirvani, H., Etminan, A., Safari, H. 2014a. Genetic variation of Agropyron trichophorum accessions using ISSR molecular marker. Journal of Biodiversity and Environmental Sciences, 5 (4), 23-30.
  24. Shirvani, H., Sfari, H., Ershadimanesh, Kh., & Sadeghi, G. R. 2014b. Genetic variation among accessions of Festuca arundinacea Based on storage protein and soluble protein by SDS polyacrylamide gel electrophoresis. International Journal of Biosciences, 4 (2), 133-140.
  25. Valizadeh, M. 2001. Seed Storage Protein Profile of Grain Legumes Grown in Iran, Using SDS-PAGE. Journal of Agricultural Science and Technology, 3, 287-292.
  26. Zarafshani, F., Safari, H., & Etminan, A. R. 2020. Genetic diversity assessment of Agropyron cristatum accessions using ISSR marker. Modern Genetics, 15 (1), 69-73. [In Persian].
  27. Zietkiewicz, E., Rafalski, A., & Labuda, D. 1994. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) - Anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics, 20, 176-183.
  28. Zohrabi, E., Etminan, A. R., Safari, H., & Jafari, A. A., 2011. Forage production stability in some accessions of Elymus hispidus using AMMI model and other methods for analyzing stability in stressed and non stressed conditions. Journal of Rangeland, 5 (2), 209-218. [In Persian].
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 158
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 196


سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب